Коментальні бактерії допомагають імунній системі розпізнавати хвороботворні мікроорганізми. Через це вони вважаються добрими. Патогенні бактерії при попаданні в організм здатні викликати захворювання. Ці бактерії можуть поширюватися через воду, повітря, ґрунт, а також за фізичного контакту.

За впливом на організм бактерії поділяються на: корисні (лактобактерії та біфідобактерії), умовно патогенні (кишкова паличка), а також на патогенні (протей та стафілокок). Найбільш важливими для людського організму вважаються біфідобактерії.

Грампозитивні бактерії (позначаються Грам (+)) бактерії, які при промиванні, при використанні забарвлення мікроорганізмів за методом Грама, виявляються міцно забарвленими в синій колір, зберігають забарвлення, не знебарвлюються, на відміну від грамнегативних бактерій.